2025年2月19日我所吳志強團隊與華東師范大學何桂梅團隊聯合在Molecular Biology and Evolution雜志在線發表了題為“Avian Migration-Mediated Transmission and Recombination driving the Diversity of Gammacoronaviruses and Deltacoronaviruses”的論文。

隨著COVID-19等動物源性傳染病的暴發，野生動物攜帶病毒的潛在風險受到越來越多的關注。蝙蝠、鼠類等野生動物是多種高風險病毒的天然儲存宿主，而候鳥作為跨洲際遷徙的生物類群，可能在病原體的全球擴散中發揮了重要作用。研究團隊圍繞東亞-澳大利亞遷徙路線的重要經停站上海的崇明東灘濕地、九段沙濕地和南匯東灘濕地，以系統分析2019年4月-2023年4月期間遷徙鳥類群體的病毒組特征為基礎，進一步研究了372份冠狀病毒陽性樣本。系統發育分析揭示這些病毒隸屬于5個與鳥類相關的冠狀病毒亞屬，并展現出高度的遺傳多樣性與復雜的重組特征；為構建更全面的鳥類冠狀病毒進化框架，研究團隊整合全球范圍內可獲取的鳥類冠狀病毒數據，通過本研究新發現的3種冠狀病毒以及重新分類的1個病毒種，將鳥冠狀病毒的種類由12種擴展至16種；研究進一步發現雁形目（Anseriformes）、鸻形目（Charadriiformes）和鵜形目（Pelecaniformes）的遷徙鳥類是Gamma和Delta冠狀病毒的主要宿主，強調了候鳥的關鍵宿主地位，而家鴨（domestic ducks）在遷徙鳥類與非遷徙鳥類之間的病毒傳播過程中發揮了重要的橋梁作用。該研究創新性地以一個采樣點的長期監測反映了全球遷徙鳥類冠狀病毒的復雜遺傳進化和傳播動態，為我國前瞻性預該類病毒的跨境輸入和輸出提供了數據和技術支撐。

圖.鳥類冠狀病毒遺傳進化及跨種傳播的示意圖

該研究獲得了國家自然科學基金（32172943, 32370176，82221004）、中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程（2023-I2M-2-001，2022-I2M-CoV19-002，2021-I2M-1- 038）、國家重點研發計劃（2022YFE0210300）、科技基礎資源調查專項（2022FY100901）等項目的資助。我所吳志強研究員和華東師范大學何桂梅研究員為文章的共同通訊作者。華東師范大學博士研究生徐玉婷，我所助理研究員韓業林、博士研究生許盼盼、助理研究員周思宇為文章的共同第一作者。