迄今為止，絕大多數(shù)在人間流行的傳染病病原體都被證實或高度懷疑來源于野生動物宿主或者媒介生物攜帶病毒的跨種傳播，如埃博拉病毒、拉沙熱病毒和當(dāng)前引起全球大流行的新型冠狀病毒等。以往我們對野生動物攜帶病毒的總體特征缺乏系統(tǒng)性研究，對其遺傳多樣性、進(jìn)化特征和變異規(guī)律等基礎(chǔ)問題缺乏研究，在面對新發(fā)傳染病暴發(fā)時，不能快速溯源其源頭，因此，亟需闡明與人類新發(fā)傳染病密切關(guān)聯(lián)的野生動物及媒介生物攜帶的病毒組特征，加強(qiáng)其基礎(chǔ)病毒學(xué)及病原學(xué)研究，并以此為基礎(chǔ)建立完善的監(jiān)測、預(yù)警和溯源體系，從而實現(xiàn)新發(fā)傳染病防控由被動轉(zhuǎn)向主動的轉(zhuǎn)變，真正將防控關(guān)口前移。

翼手目動物（蝙蝠）和嚙齒目動物（鼠類）數(shù)量多、分布廣，是引發(fā)動物源性人類新發(fā)傳染病的兩大類最主要的哺乳類野生動物。金奇課題組的吳志強(qiáng)研究員等繼2016年在《ISME Journal》、2018年在《Microbiome》等雜志發(fā)表系列文章初步揭示了全國范圍內(nèi)代表性蝙蝠和鼠類呼吸道/消化道病毒組特征后，在傳染病防治重大科技專項“一帶一路”項目的支持下與泰國農(nóng)業(yè)大學(xué)等東南亞地區(qū)優(yōu)勢單位合作開展了東南亞地區(qū)嚙齒目動物攜帶病毒組特征的研究工作，通過對覆蓋泰國、老撾和柬埔寨三國18個省30個物種共計3284只鼠類和食蟲類等小動物的肺組織樣本宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)東南亞地區(qū)的嚙齒目動物的病毒涉及98個病毒科（包含24個哺乳動物病毒科）和多種未分類的RNA病毒，鑒定獲得了216個新病毒種/株。其中一些重要病毒如漢坦病毒、砂粒病毒、白蛉病毒、黃病毒和未分類RNA病毒等。

上述研究為國際上首次針對東南亞地區(qū)開展大范圍、多鼠種的病毒組研究，其結(jié)果不僅有助于全面了解動物病毒生態(tài)的多樣性，而且為構(gòu)建動物源性傳染病預(yù)警、溯源診治體系提供了重要數(shù)據(jù)，為提升我國應(yīng)對境外新的動物病毒及可能引發(fā)的新發(fā)傳染病提供了技術(shù)支撐。

該工作得到了國家科技重大專項（2018ZX10101001和 2018ZX10711001），國家自然科學(xué)基金（81772228）和中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程（2020-I2M-CoV19-010, 2016-I2M-1-014和2017-I2MB&R-12）等項目的資助。