RNAi技術被廣泛用于基因敲減和病毒感染宿主因子的篩選。相比siRNA轉染，慢病毒載體介導的shRNA轉導效率高，因此得到更廣泛的應用。趙振東課題組黃鶴副研究員等發現慢病毒介導的陰性對照shRNA穩定轉導可抑制HCV感染。miRNA芯片分析結果顯示，慢病毒穩定轉導可導致宿主細胞miRNA表達譜發生改變，其中miR-216a-5p、216b-5p、217和30b-5p可抑制HCV復制。進一步研究顯示，這種非特異效應不依賴shRNA的轉錄，而來源于慢病毒載體本身，慢病毒的整合位點也決定宿主miRNA是否發生改變。該研究還發現慢病毒載體可上調JUN的表達，進而上調上述miRNA的表達。雖然宿主miRNA表達譜的改變有利于控制HCV感染，但慢病毒引起的這種非特異效應該得到關注，尤其當慢病毒載體用于基因治療時可能由此誘發副反應。