人體微生物組研究飛速發展，多項研究表明人體腸道共生微生物在腫瘤、代謝性疾病、神經精神疾病、炎癥性疾病等多種疾病發生發展中扮演重要角色，因此，近年提出從功能微生物組角度來闡釋其與在人體疾病發生中的調控作用，采用的宏轉錄組測序方法不僅能獲得活性微生物組譜，還有助于揭示更多的功能元件，同時可以獲得人體的轉錄組，探究微生物組和宿主之間的相互作用。與腸道微生物組研究領域比較，肺部微生物組研究進展較慢，已有的研究多基于16S測序數據，且對肺部微生物組組成與臨床特征的關聯尚不完全清晰。王健偉課題組的任麗麗研究員等，通過對25名慢性阻塞性肺疾病（COPD）和9名正常對照人群肺部灌洗液中存在的功能微生物組的研究，發現肺部存在三種不同的微生物組成，它們與菌總量，Th17細胞分化和COPD加重頻次顯著相關。該結果支持人體肺功能微生物組存在不同“核心主成分”特征，并與人體免疫調控密切相關。這項研究是首次從功能微生物組角度闡釋了肺部微生物組組成特征，對于深入了解肺微生物組在維護局部微環境穩態作用，以及闡釋呼吸道感染機理方面提供了新的視角。該論文以題為Transcriptionally Active Lung Microbiome and Its Association with Bacterial Biomass and Host Inflammatory Status》在線發表在《mSystems》雜志，被主編選定為當期Editor’s Pick。